近年来，烟草研究所认真贯彻习近平总书记“三个面向”、“两个一流”重要指示精神，根据“一主体两拓展”发展定位，对传统学科领域、创新团队进行了重新优化调整，新成立了植物功能成分研究中心，组建了“烟草功能成分与综合利用”创新团队，以“生态、特色、健康”为发展理念，以功能农业为研发方向，重点开展烟草及特种作物功能成分解析、生物活性评价、功能产品研发及综合利用研究等，取得了一批研究成果。2015年至今，“烟草功能成分与综合利用”创新团队已发表SCI/EI论文37篇，授权国家发明专利12项，在烟草功能成分研究领域已建设成国内领先、国际知名的研究团队。
为充分发挥功能农业在乡村振兴科技支撑行动中的重要作用，烟草所与宣城市人民政府、中国烟草总公司安徽省公司签订了《宣城现代功能农业科创园战略合作框架协议》，与皖南烟叶有限责任公司联合组建长三角生物功能产品研究院。同时，新建了烟草所宣城试验基地，建立了特种功能作物资源圃，开展了特种作物资源收集与开发应用。资源圃里种植了20类植物，共29个品种，包括菰米、泥豆、金丝皇菊、虎杖、紫苏、猫薄荷、薏米、功能稻等。这些品种各有特色，具有很大的开发潜力。烟草所科技人员研究发现，菰米具有抑制α-葡萄糖苷酶、降血糖、降血脂和改善肠道菌群等方面的生物活性和保健价值。开发出烟籽油、烟花提取物、宣木瓜抗氧化成分、鹰嘴豆异黄酮、泥豆活性成分、芳香植物功能成分等多种产品和有益成分提取技术，并逐步应用于新产品开发。通过功能产品的研发，可以推进农村一二三产业深度融合，大幅提升农产品附加值，显著提高农民收入。
烟草所紧紧抓住产业需求这个“关键词”，重点针对当地农业生产瓶颈问题做文章。皖南是全国太子参三大产区之一，太子参具有益气健脾、生津润肺的功效，是一味营养价值很高，温和滋补的中药，但在种植过程中很容易感染病毒病，导致太子参产量低，品质下降，亩产量仅有75-100kg。烟草所的科学家针对这一技术难题，组成由中国农业科学院“青年英才计划”人选张洪博研究员牵头的攻关小组，成功研发出太子参组织培养脱毒技术。经过示范种植，脱毒苗表现突出，病毒病发病率为零，太子参个大饱满，推广潜力巨大，预计每亩可以增收4000元以上。此项目已与皖南烟叶公司签订了合作开发协议，当地太子参种植大户也纷纷前来参观学习，表达出引进脱毒种苗的强烈意愿。此项技术推广应用后，能够解决皖南乃至全国太子参病毒病高发的问题，可以产生巨大的经济效益和社会效益。
烟草所宣城功能农业发展模式引起了社会的广泛关注，成为当地现代农业技术孵化的典型代表。安徽电视台、新华社、中经社、人民网、央广网等新闻媒体先后到宣城基地采访报道。2018年6月12日，作为“全国烟农增收工作现场会”主要参观点之一，展示内容和成果得到了与会代表的高度评价。据不完全统计，自2018年6月份以来，宣城基地接待来自全国各地各级政府机构、烟草系统、高等院校、科研院所、涉农企业、社会团体、农业合作社等80余批次1000余人次来调研考察、参观学习和洽谈合作。宣城市及周边地区各阶层人士络绎不绝的自发到基地参观，对当地农业发展产生广泛而持续的影响。同时，宣城基地解决周边农民就业，为他们带来稳定的经济收入；还带动了周边乡村服务业的发展，民宿和餐饮借助宣城现代功能农业科创园的建设，纷纷发展起来。
潮平两岸阔，风正一帆悬。烟草所将紧紧围绕长三角现代农业发展需求，紧跟乡村振兴战略，紧贴功能农业定位，紧扣农民增收脉搏，加快培育农业农村发展新动能，推动传统农业向科技创新转型、生态健康转型、品牌导向转型、全产业链转型，为打造现代农业升级版、实现农业高质量发展、助推乡村振兴战略实施提供强有力技术支撑。